Jacob Thuesen (* 25. Mai 1962 in Kopenhagen) ist ein dänischer Cutter und Filmregisseur. Jacob Thuesen studierte Film an der Staatlichen Filmhochschule in Kopenhagen. Das Studium schloss er 1991 ab und begann als Cutter zu arbeiten. Als Cutter arbeitete er u. a. für Lars von Trier, Susanne Bier und Annette K. Olesen. Als Regisseur drehte er zun